Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic2Q62520 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms