Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SypQ62277 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SypQ62277 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SypQ62277 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SypQ62277 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SypQ62277 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SypQ62277 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SypQ62277 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SypQ62277 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SypQ62277 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms