Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms