Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms