Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RhocQ62159 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhocQ62159 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms