Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg2Q61878 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prg2Q61878 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg2Q61878 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg2Q61878 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Prg2Q61878 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg2Q61878 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg2Q61878 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prg2Q61878 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prg2Q61878 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg2Q61878 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg2Q61878 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg2Q61878 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prg2Q61878 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prg2Q61878 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prg2Q61878 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prg2Q61878 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms