Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms