Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms