Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AcanQ61282 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AcanQ61282 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms