Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms