Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp17laQ61068 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp17laQ61068 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp17laQ61068 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp17laQ61068 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp17laQ61068 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp17laQ61068 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp17laQ61068 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp17laQ61068 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp17laQ61068 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp17laQ61068 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms