Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms