Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn2cQ60772 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms