Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms