Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc125Q5U465 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms