Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim38Q5SZ99 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim38Q5SZ99 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim38Q5SZ99 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim38Q5SZ99 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim38Q5SZ99 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim38Q5SZ99 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim38Q5SZ99 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim38Q5SZ99 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim38Q5SZ99 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim38Q5SZ99 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim38Q5SZ99 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Trim38Q5SZ99 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Trim38Q5SZ99 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim38Q5SZ99 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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