Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NacadQ5SWP3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NacadQ5SWP3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NacadQ5SWP3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NacadQ5SWP3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NacadQ5SWP3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NacadQ5SWP3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NacadQ5SWP3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NacadQ5SWP3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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