Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms