Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AbrQ5SSL4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AbrQ5SSL4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms