Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf215Q5SPX3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms