Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha9Q5RJB0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms