Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fam20cQ5MJS3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20cQ5MJS3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms