Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
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