Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms