Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms