Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prune2Q52KR3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prune2Q52KR3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prune2Q52KR3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prune2Q52KR3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prune2Q52KR3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prune2Q52KR3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms