Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms