Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms