Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr7Q3V0I2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms