Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap65Q3V0B4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms