Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms