Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms