Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms