Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fchsd2Q3USJ8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms