Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms