Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog7Q3UM29 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms