Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms