Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms