Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms