Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms