Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Fam117bQ3U3E2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam117bQ3U3E2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam117bQ3U3E2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam117bQ3U3E2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam117bQ3U3E2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam117bQ3U3E2 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam117bQ3U3E2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam117bQ3U3E2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Fam117bQ3U3E2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam117bQ3U3E2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms