Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Hvcn1Q3U2S8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Hvcn1Q3U2S8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Hvcn1Q3U2S8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Hvcn1Q3U2S8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hvcn1Q3U2S8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms