Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms