Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms