Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd33bQ3U0L2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms