Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrn4clQ3TYX2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn4clQ3TYX2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn4clQ3TYX2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn4clQ3TYX2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn4clQ3TYX2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrn4clQ3TYX2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Lrrn4clQ3TYX2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrn4clQ3TYX2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrn4clQ3TYX2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Lrrn4clQ3TYX2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms