Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTL0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms