Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TQQ9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TQQ9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms