Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms