Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms